La majorité des inscrits à ce tutoriel ayant déjà des connaissances en R, Laurent ne reviendra pas sur les éléments de base. Par ailleurs, afin de tirer parti au maximum du tutoriel, il est nécessaire de venir avec un ordinateur portable, sur lequel seront préalablement installée :
- Une version récente de R (cf . http://www.r-project.org/, version 3.1.1 ou version 3.1.2).
- Nous vous conseillons aussi d’installer l’environnement de développement R Studio (http://www.rstudio.com/), bien que cela ne soit pas obligatoire, si vous préférez travailler dans un autre environnement dont vous avez l’habitude.
Il est aussi nécessaire d’installer un ensemble de packages, sur lesquels le tutoriel se basera. Pour cela, lancez R, et exécutez les deux commandes suivantes :
- source("http://bioconductor.org/biocLite.R »)
- biocLite("RforProteomics", dependencies = TRUE)
Si vous rencontrez le moindre problème, Laurent vous propose de poser une question sur le site web officiel de support du Bioconductor (https://support.bioconductor.org/), en utilisant le tag « RforProteomics », ainsi que n’importe quel autre tag vous semblant approprié. Laurent répondra à votre question très rapidement.