Mercredi 19 novembre après-midi
Cette première demi-journée sera consacrée à deux tutoriels T1 & T2 qui se dérouleront en parallèle.
- T1 : Laurent Gatto (Cambridge Center for Proteomics, Cambridge) : « An introduction to R/BioConductor for computational proteomics ». Important : pour ce tutoriel il faut se référer aux instructions spécifiques.
Le contenu du tutorial R est accessible en ligne. - T2 : Caroline Truntzer (Clinical Proteomic Platform, Dijon): « Introduction aux biostatistiques pour la découverte de biomarqueurs ». Voici le lien sur les transparents du tutoriel.
- 13h30-14h00 : Accueil des participants aux tutoriels
- 14h00-15h15 : Tutoriels, partie I
- 15h15-15h45 : Pause-café
- 15h45-17h00 : Tutoriels, partie II
Jeudi 20 novembre
- 9h00-9h45 : Accueil des participants + café/thé
- 9h45-10H00 : Ouverture des journées
- 10H00-11H00 : Conférence d’introduction : Yohann COUTE (INSERM, EDyP, Grenoble)
« Défis de la protéomique quantitative label-free » - 11H00-11H30 : Pause-Café + installation des posters des participants
- 11H30-12H30 : Conférence « visual analytics » : David AUBER (LaBRI, Bordeaux)
« Visualisation interactive de données avec Tulip. Application aux réseaux biologiques » - 12H30-14H00 : Repas
- 14H00-15h30 : Atelier Visualisation, partie I : collecte des besoins de la communauté Protéomique
- 15h30-16h30 : Session participant I : bioinformatic tools (programme détaillé)
(présentation de 10 min sans questions pour préparer les posters) - 16h30-17h00 : Pause-Café
- 17h00-18h00 : Session poster I
(elle est située à côté de la salle de café, de sorte qu’il y a continuité entre la pause et la session poster) - 18h00-19h45 : libre
- 19h45 : Diner de conférence au Restaurant « A Confesse »
Vendredi 21 novembre
- 9h00-10h00 : Conférence « Machine Learning » : Jean-Philippe VERT (Inst. Curie, Ecole des Mines, Paris)
« Machine Learning for personalized medicine » - 10h00-10h30 : Pause-Café
- 10h30-11h30 : Session participant II : biostatistics and biomarker discovery (programme détaillé)
(présentation de 10 min sans questions pour préparer les posters) - 11h30 -12h30 : Conférence « Big Data » : Sihem AMER-YAHIA (CNRS, LIG, Grenoble)
« Big User Health Data Management » - 12h30- 14h00 : Repas + Session poster II
- 14h00-15h00 : Conférence « Spectrométrie de masse » : Marc-André DELSUC (CNRS, IGBMC, Strasbourg)
« Big data et traitement de données en Spectrométrie de Masse : le projet MesureHD » - 15h00-16h00 : Atelier Visualisation, partie II : Restitution
- 16h00-16h15 : Remerciement et conclusion
NB : Le dernier jours, l’horaire de clôture a été déterminé afin que les participants puissent aisément arriver à la gare de Grenoble (trajet direct en tramway – ligne B, en 25 minutes environ) avant 17h00, à temps pour les trains de 17h20 pour Paris, de 17h30 pour Marseille, ou de 17h54 pour Genève.